1 января 1999 года на основании приказа Минюста России № 182 от 11.12.1998 года, УИН МЮ РФ по Новгородской области принимает от войсковой части № 5491 функции конвоирования по двум плановым железнодорожным маршрутам, встречное конвоирование, а от УВД Новгородской области конвоирование по двум плановым автомобильным маршрутам. В составе УИН Минюста России по Новгородской области в январе 1999 года создаётся отдел по конвоированию. Основу коллектива составили сотрудники роты розыска, конвоирования и обеспечения тогда еще УИН и военнослужащие войсковой части № 5491. Первый караул по конвоированию был выполнен 4 января 1999 года.
С января 1999 года отдел находится в п. Панковка Новгородского района.
Сегодня на страже порядка и законности в созданном 22 года назад подразделении стоит около 70 человек, многие из них имеют боевой опыт службы в «горячих точках».
Несмотря на сложную оперативную обстановку и увеличивающийся с каждым годом объем перевозок с момента образования учреждения и по настоящее время сотрудниками Федерального казенного учреждения "Отдел по конвоированию УФСИН России по Новгородской области" не допущено побегов, происшествий на службе и нарушений служебной дисциплины.
В настоящее время отдел по конвоированию является динамично развивающимся подразделением, костяк которого составляют опытные сотрудники, стоявшие у истоков создания отдела.
Служба в конвое требует высокой концентрации внимания, строжайшей дисциплины и быстрой реакции на внештатные ситуации.
Сотрудники отдела принимали участие в контртеррористической операции в составе группировки федеральных сил в Северо-Кавказском регионе Российской Федерации.
Личный состав отдела это два отделения, а также сотрудники кадровых, экономических, тыловых служб. В настоящее время личный состав отдела выполняет задачи по конвоированию спецконтингента по плановым автодорожным, сквозным маршрутам; встречное конвоирование и другие служебные задачи. Сотрудники отдела всегда находятся в полной готовности для решения любых служебных задач: от конвоирования осужденных и подследственных до розыска и задержания лиц, совершивших побег из учреждений уголовно-исполнительной системы; пресечения массовых беспорядков среди осужденных и лиц, содержащихся под стражей. За образцовое выполнение заданий, проявленные при этом мужество, стойкость, преданность служебному долгу многие из них удостоены ведомственных наград.
Начальник УФСИН России по Новгородской области и весь личный состав поздравляет сотрудников ФКУ Отдел по конвоированию с профессиональным праздником!